DNA測序儀目前主要供研究之用，是生物學(xué)家們所能購買的較為昂貴儀器之一，然而，在美國政府削減研究經(jīng)費且未來的經(jīng)費前景也不容樂觀之際，許多研究機構(gòu)正暫緩購置設(shè)備，儀器生產(chǎn)商受到重創(chuàng)。 據(jù)《自然》雜志在線新聞報道，在經(jīng)歷了2011年第三季度市場銷售下滑后，許多測序儀制造商開始裁員和削減成本，同時寄希望于醫(yī)學(xué)診斷需求的擴大能有助于市場的繁榮。
迄今為止，DNA測序儀制造商或測序服務(wù)在美國的主要用戶是受政府資助的研究人員，特別是獲國立衛(wèi)生研究院（NIH）資助的研究人員。然而，盡管NIH在2011年的預(yù)算只比2010年少1%，分析家們預(yù)測政府在2012年和2013年的預(yù)算還會有更大幅削減，對測序儀市場產(chǎn)生沖擊。
由于擔(dān)心政府資金減少，研究機構(gòu)將更謹慎地開銷。日前由在線出版物基因組網(wǎng)和東京投資銀行瑞穗證券發(fā)布的報告指出，在接受調(diào)查的94位基因組科學(xué)家中，58%的人表示他們因經(jīng)費緊縮而推遲購買儀器;42%的人表示在未來1年里不會購買新DNA測序儀。
位于加州卡爾斯巴德的生命技術(shù)公司表示，得益于離子洪流機器的強勁銷售，公司2011年第三季度的銷售比2010年同期增加7%，但考慮到未來的困難，公司仍計劃裁員并削減成本。今年9月，位于加州門洛帕克的太平洋生物科學(xué)公司被迫裁減28%的員工，約130人，并降低其2011年的收益預(yù)測。
新一代基因組測序儀可應(yīng)用于臨床遺傳風(fēng)險的篩選和遺傳疾病的診斷。在現(xiàn)實令人憂心、未來不容樂觀的情形下，許多測序公司將目光對準了生物醫(yī)學(xué)的新市場。比如，熒光公司設(shè)立了商業(yè)部，促進其工具在臨床診斷中的應(yīng)用。與此同時，生命技術(shù)公司宣布將推出一項幫助預(yù)測患者對一種新癌癥藥物個體反應(yīng)的基因試驗，該藥由總部位于英國的制藥公司葛蘭素史克研制，已進入第三期臨床試驗;生命技術(shù)公司還表示將在俄羅斯開展一個900萬美元的醫(yī)學(xué)分析儀器系統(tǒng)銷售計劃。 
